导致新冠肺炎(COVID-19)的新式冠状病毒(SARS-CoV-2)怎么从动物传达到人类,这是当时整个科学界都在企图处理的难题。
悉尼大学生命与环境科学学院和医学学院的进化病毒学家 Edward Holmes 教授,便是尽力解开新冠病毒来历的首要研讨人员之一。
自 COVID-19 疫情呈现以来,Holmes 教授现已撰写了四篇有关新式冠状病毒的顶刊论文,这中心还包含两篇关于该病毒的最早描绘,别离宣布在《天然》和《柳叶刀》杂志,以及近期还宣布的两篇有关病毒来历的论文,别离宣布在《天然》和《天然医学》上,还有一篇谈论文章,宣布在《细胞》杂志上。
EDWARD HOLMES 教授是悉尼大学的高档进化论专家/图源:悉尼大学
众所周知,SARS-CoV-2 是导致 COVID-19 的病毒,了解病毒来历,将能够帮忙其他科学家赶快找到有用的疫苗。Holmes 教授一向与我国和世界各地的科学家严密协作,以解锁 SARS-CoV-2 的遗传暗码。他们的作业还将有助于监测和防备其他病毒,这些病毒或许从野生动物转移到人类身上,导致所谓的人畜共患疾病。
病毒具有天然来历
3 月 17 日,《天然医学》宣布了由 Holmes 教授与加州拉霍亚斯克里普斯研讨所、爱丁堡大学、纽约哥伦比亚大学和新奥尔良杜兰大学的科学家合著的研讨。
这篇论文消除了关于新式冠状病毒是一种人工生物的臆想。
研讨团队通过对基因组数据的比较剖析,发现导致此次疫情的新冠病毒不是一种实验室构建的病毒,也不是一种被人成心操作的病毒。
Holmes 教授说:“底子没有依据标明 SARS-CoV-2 是从实验室走漏出来的。事实上,这是像我这样的研讨人员多年来一向在正告的一种天然疾病的呈现。”
此前,跟着新冠肺炎疫情的延伸,有关新冠病毒人工合成来历和实验室走漏的流言在互联网撒播甚广。
据一家监督媒体对研讨论文报导的组织 Altmetric 的剖析,Holmes 教授批驳新冠病毒人工合成的论文,已成为有史以来排名最高的学术研讨。
Holmes 教授说:“这充沛标明晰全球对这一论题的极大爱好。”
华南海鲜商场并非源头
3 月 27 日,Holmes 教授与上海公共卫生临床中心和上海市公共卫生临床中心、复旦大学生命科学学院张永振教授联合《细胞》(CELL)杂志上宣布一篇题为“A Genomic Perspective on the Origin and Emergence of SARS-CoV-2”的谈论文章。
该谈论通过体系整理现在所知的各项研讨中关于新式冠状病毒呈现的基因组数据后,就现有效果总结以为:“从武汉华南海鲜商场上收集的环境样本的基因组序列现已被获取,据进化剖析显现,它们与从武汉最早的患者身上收集的病毒十分挨近。”
武汉华南海鲜商场及其内部野生动物/图源:EDWARD HOLMES 教授 CELL 谈论
但 Holmes 教授和张永振教授一起指出,因为“并非一切的前期 COVID19 事例都与该商场有关,因而病毒源头或许比开始猜想的更杂乱”。
该谈论以为,尚不清楚样本是否来自通过商场的感染者仍是源自该地址的动物。但对该商场现在现已短少显着直接的动物采样,这在某种程度上预示着做出判别将很困难。
尽管一开始许多人都以为新冠病毒来历于我国武汉华南海鲜商场,但之后更多的研讨剖析成果也指向了比那更早的病毒来历。正如前文《天然医学》论文的合著者之一、杜兰大学医学院教授罗伯特·加里在承受媒体采访时表明,“武汉那里必定有一些病例,但并不是该病毒的源头。”
不足以证明穿山甲是中心宿主
3 月 26 日,Nature 杂志在同行评议后宣布了一篇有关穿山甲中发现相似新冠病毒的文章,发现从私运到我国的少量穿山甲中检测到的冠状病毒,与 SARS-CoV-2 具有较近的亲缘联络。
论文通讯作者为管轶教授和广西医科大学胡艳玲教授,Holmes 教授也是论文作者之一,而且是该论文中仅有的非我国学者。
论文曾于 2 月 20 日在预印本网站 bioRxiv 宣布。
研讨团队对取自 18 只马来穿山甲的样本进行了剖析,这批穿山甲是 2017 年 8 月至 2018 年 1 月在我国南部展开的反私运举动中抄获的,成果在其间 5 只穿山甲体内检测到了 SARS-CoV-2 的近缘冠状病毒。
之后,研讨人员又在 2018 年在第二个省抄获的别的 12 只穿山甲中的 3 只,以及在 2019 年收集了样本的第三个省的 1 只穿山甲中,别离检测到了相似的冠状病毒。
论文指出,在穿山甲样本中发现了新冠病毒相关冠状病毒,归于此次新冠病毒的两个亚型,其间一个受体结合域与新冠病毒亲近相关。
可是 Holmes 教授说:“穿山甲病毒在 SARS-CoV-2 的呈现中所起的效果,现在依然不清楚。”
2 月 7 日,华南农业大学曾对外发布音讯称,穿山甲为新式冠状病毒潜在中心宿主,穿山甲一夜之间成为“众矢之的”。但实际上,研讨人员在论文中表述的病毒基因高相关性,只触及受体结合域特定位点,并没有触及整个基因组。华南农业大学的研讨人员在之后发布会上也解说说,这是生物信息学小组和研讨实验室之间令人为难的过错交流的成果。
发现 SARS 病毒来历小组成员之一的新加坡国立大学医学院病毒学家王林也宣布示,“即便这两种病毒的受体结合域到达 99% 的相似度,也不足以阐明两者的联络”。
加拿大麦克马斯特大学研讨冠状病毒的研讨人员 Arinjay Banerjee 表明,“确认宿主的基因相似性应该比这些研讨报告的要高。SARS 病毒与果子狸冠状病毒有 99.8% 的基因组相同,这便是为什么果子狸被以为是病毒的来历。假如穿山甲是此次疫情迸发的本源,那么也不会是这些研讨中的这些穿山甲。”
尽管这种相似程度不足以阐明穿山甲是直接参与当时 SARS-CoV-2 迸发的中心宿主,但研讨成果标明,穿山甲是冠状病毒的第二个哺乳动物宿主,应严令制止野生动物商场生意穿山甲,然后将未来病毒感染人类的危险降至最低。
未来还会呈现更多的新病毒”。
Holmes 教授说:“很显着,野生生物中含有许多将来或许会在人类中呈现的冠状病毒。从这场大盛行中有助于防备下一次盛行的重要经验是,人类有必要削减与野生生物的触摸,例如制止湿商场和野生动植物交易。”
未来或许呈现更多新病毒
前期的基因组比较显现,在蝙蝠身上发现了与 SARS-CoV-2 联络最亲近的病毒。而近年来导致最严峻感染性疾病的 SARS 病毒、MERS 病毒、埃博拉病毒、马尔堡病毒,都来历于蝙蝠。
不过,现在蝙蝠在 SARS-CoV-2 的人畜共患来历中所起的切当效果没有确认。
在《细胞》谈论文章中,Holmes 教授等人以为,SARS-CoV-2 病毒很或许成为人类第五种大盛行的冠状病毒,而且现在正在彻底易感人群中传达。
研讨人员表明,“冠状病毒明显具有逾越物种鸿沟并习惯新宿主的才能,然后咱们咱们能够很容易地猜测,
因而,人类需求更多的研讨来协助拟定公共卫生方针,以应对相似病毒的呈现。Holmes 教授等人也指出了有助于避免其他冠状病毒对人类健康构成威胁的方针和其他办法,包含:
1.对各种哺乳动物中的冠状病毒进行监测。众所周知,蝙蝠带着许多冠状病毒,咱们对其他物种还带着这些病毒以及哪些潜伏在人类中的或许性知之甚少。
2.加大对不合法生意野生动物的监管力度。鉴于野生动植物中病毒的多样性以及它们的继续进化,能够说,下降未来迸发危险的最简略、最具本钱效益的办法是尽或许约束咱们对动物病原体的触摸。
3.将哺乳动物或鸟类野生动物从菜商场或海鲜商场上清出。“明显野生动物体内含有许多冠状病毒,这些病毒有或许感染人体。这次疫情迸发的一个重要经验是:人类有必要削减与野生动物的触摸,例如制止野生动物交易。”Holmes 教授说道。
参考资料:
https:///articles/s41586-020-2169-0
3 月 26 日 Cell 谈论:
https:///cell/fulltext/S0092-8674(20)30328-7
3 月 17 日 Nature Medicine 论文:
https:///articles/s41591-020-0820-9
2 月 3 日 Nature 论文:
https:///articles/s41586-020-2008-3
1 月 22 日 Lancet 论文:
https:///journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30251-8/fulltext#